Bioinformatiker*in (d/f/m)

Unternehmensbeschreibung

Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patient*innen und Bürger*innen zu erreichen. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.

Wir suchen für die Sektion Exploratory Diagnostik Science (EDS) in der Arbeitsgruppe von Prof. Dr. Dieter Beule zum 01.01.2025 befristet bis zum 31.08.2026 eine*n

Bioinformatiker*in (d/w/m)

in Vollzeit (38,5 Wochenstunden)

Der Forschungsschwerpunkte der AG liegt in der Entwicklung von Methoden zur effizienten, reproduzierbaren und zuverlässigen Omics-Datenanalyse und der Entwicklung neuer Technologien zur interdisziplinären Datennutzung einschließlich aller notwendigen System- und Prozessinnovationen.

Das erwartet sie

• Planung und Umsetzung von bioinformatische Forschungsprojekten auf Basis der Analyse von biomedizinischen Anforderungen
• Entwicklung von Software und Workflows zur Analyse von NGS Daten; Auswahl und Benchmarking von Algorithmen, Bibliotheken und Werkzeugen
• Entwicklung innovativer Ansätze für die Analyse von Sequenzdaten, wo Standardmethoden nicht angemessen sind
• Mitarbeit bei der Weiterentwicklung von open source Produkten der AG insb. VarFish, Mehari, SODAR und Snappy
• Interpretation und Präsentation von Ergebnissen vor Kolleg*innen und Kooperationspartner*innen
• Präsentation und Veröffentlichung der Forschungsergebnissen
• Mitarbeit bei der Betreuung von Doktorand*innen bzw. Masterand*innen

Das bringen Sie mit

• Master in Bioinformatik, Informatik o.ä. sowie mindestens 3 Jahre Arbeits-/Forschungserfahrung in der Analyse von WGS-Daten
• Sehr gut Kenntnisse in Softwareentwicklung erforderlich, Python und bash werden vorausgesetzt, Erfahrung mit Rust, R und Datenbanksprachen von Vorteil, sehr gute Software Engineering Kenntnisse erwartet
• Fundierte Kenntnisse von Computational Methoden zur Analyse von NGS-Daten und in der Nutzung öffentlicher Datenquellen, bioinformatischer Datenbanken und Dateiformaten
• Nachgewiesene Erfahrung in der Erstellung von gut konzipierten und dokumentierten Quellcode, gute Kenntnisse im Umgang mit git notwendig
• Nachgewiesene Fähigkeit in der produktiven Arbeit mit einer existierender Codebasis
• Qualifiziert im Umgang mit Linux, HPC, Openstack, Docker und scientific workflow management systems
• Erfahrung im wissenschaftlichen Schreiben und Publizieren, relevante Promotion von Vorteil

Das bieten wir Ihnen

• Eine abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsweisenden Forschungsinstitut
• Vergütung unter Berücksichtigung der persönlichen Voraussetzungen bis TVöD VKA-K EG 13
• Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
• Flexible Arbeitszeiten/ 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
• Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
• Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Mobiles Bürgeramt vor Ort
• Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, Fahhradleasing oder -abo (JobRad, mylo)
• Attraktiver Arbeitsplatz im Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin

Wir leben Vielfalt!

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.

Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.

Ihre aussagekräftige Bewerbung reichen Sie bitte über das BIH Karriereportal (https://jobs.bihealth.org) mit Motivationsschreiben, Lebenslauf und relevanten Arbeits- und Abschlusszeugnissen bis zum 31.10.2024 unter Angabe der Kennziffer 3869 ein.

Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden sie unter: https://www.kmk.org/zab/zentralstelle-fuer-auslaendisches-bildungswesen.html

Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.

Nähere Informationen zum BIH finden Sie unter www.bihealth.org.

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